O Supermercado Cerqueira, uma empresa familiar fundada pelo patriarca Sebastião Lessa de Cerqueira, não teve sua origem como supermercado. Para melhor compreender sua história é preciso conhecer um pouco da vida de seu fundador.​
Sebastião nasceu em uma família humilde na zona rural de São Filipe, mais especificamente no Mutum. Perdeu sua mãe Maria Oliveira Lessa aos sete anos de idade e seu pai Galdino Cardeal Cerqueira aos 12. Era uma família numerosa, dez filhos ao todo, devido à falta de recurso, cada filho teve um destino diferente, dentro do seio da própria família como também da comunidade.​
Luis Cerqueira, seu primo, comerciante da cidade o levou para trabalhar em sua mercearia. Muito hábil e inteligente, Bastião ou simplesmente Tião, como era chamado, logo se adaptou ao novo modo de vida e cresceu sendo um funcionário exemplar. Luis Cerqueira era um homem empreendedor e em pouco tempo expandiu seu comércio e entrou no ramo promissor da época, comprador de fumo, no qual construiu um enorme galpão que atualmente abriga diversas empresas na rua Dom Macedo Costa. Construiu também um bar e sorveteria denominado 2 de julho, na rua Nova Brasília. Tornou-se um comerciante bem sucedido e também já figurava na política com forte atuação.​
No ano de 1966, aos 29 anos de idade, Sebastião continuava sendo o principal funcionário de Luis Cerqueira, que lançara sua candidatura a prefeito de São Filipe, com totais chances de se eleger. Lamentavelmente não foi possível esta constatação pois, em plena campanha eleitoral, Luis Cerqueira sofreu um infarto fulminante e veio a falecer, deixando todos abalados. Sebastião já estava totalmente envolvido nos negócios e política de Luis Cerqueira, com isso deu continuidade aos ideais de seu grande mestre, juntamente com familiares e correligionários.​
Nesta altura de sua vida, já estava casado com a professora Tereza Constança Barbosa Cerqueira e já possuía um filho, o primogênito Evandro Barbosa de Cerqueira. Com visão empreendedora, conseguiu negociar com os herdeiros de Luis Cerqueira a compra do imóvel da sorveteria, com a ajuda de sua esposa e empréstimo de amigos, fundando assim sua primeira empresa com nome fantasia: Bar e Sorveteria Q’Ótimo, considerado ponto de partida do atual Supermercado Cerqueira.​
A localização não poderia ser melhor, no coração do comércio sanfilipense, onde até os dias de hoje funciona a tradicional feira livre. O movimento era intenso, quem não se recorda do famoso refresco de coco, o preferido da população, que “vendia mais do que água”, além dos picolés e sorvetes de frutas. Outro momento marcante era no revellon, quando tinha movimento o dia inteiro e virava a madrugada até amanhecer o novo ano.​
O tempo passa e o negócio prospera, então Sebastião resolve inovar, divide o espaço do bar em dois, criando um balcão para funcionar uma pequena mercearia, ramo de atividade no qual tinha bastante experiência. Com esse passo, surge o início do sonho de crescer e chegar a ter um supermercado, pois nessa época já existia um na cidade, na mesma rua, o Supermercado Santana, do saudoso amigo e também empreendedor Manoel Neiva Santana, popular Neco Neiva.​
Como já era esperado, devido sua simpatia e carisma, a clientela só aumentava, o espaço estava insuficiente para manter os dois negócios em um único imóvel. Foi aí que, em 1982, ele adquiriu um imóvel de propriedade do comerciante e político Edmundo Andrade Silva, onde funcionava um depósito de farinha. Neste local foi aberta uma filial, a Casa do Povo, uma mercearia bem sortida, com melhor espaço e condições de crescimento.​
Com muito trabalho e dedicação o comércio prosperou, além de vender no varejo, já funcionava também a venda em atacado, inclusive com entrega em São Roque do Paraguaçu e Capanema. Além de comerciante, Tião nunca abandonou a política, sempre esteve atuante, sendo vereador por quatro vezes nas décadas de 60 e 70.​

O sonho de montar um supermercado estava mais perto. Certo momento ele chegou a contratar um projetista para desenhar a planta de um supermercado neste imóvel, mas não chegou a executar. Neste período, a cidade já possuía três supermercados, o Santana de Dona Zélia Neiva, viúva de Sr Neco Neiva, o de seu filho Antonio Neiva, Supermercado Santo Antônio e o Supermercado Ferreira, do saudoso Raimundo Ferreira, conhecido na época como Raimundo do Café Cravo.​
Este último supermercado fechou em pouco tempo e o imóvel foi alugado ao Supermercado Rio Branco em 1985, que também não demorou muito a fechar. Com o fechamento, surge então a possibilidade de se comprar o imóvel. Sebastião conseguiu negociar com Sr. Raimundo e atingiu o seu objetivo principal, transformando seu sonho em realidade. Para adquirir este imóvel ele tomou empréstimos e se desfez de muito bens adquirido no longo de sua vida, ou seja, apostou alto neste novo e almejado empreendimento.​
A partir de agora, a empresa passa a ser chamada Supermercado Cerqueira, sua inauguração foi em 17 de outubro de 1987. No início, com poucos recursos devido à compra do imóvel, Tião observava o espaço enorme das prateleiras, feitas na serraria de Zé de Julio, com madeira de primeira qualidade, em forma de pirâmide, tendo frisos de fórmica amarela, e comentava: “quanto espaço para se colocar mercadoria! Será que nós vamos conseguir preenchê-los?” Na realidade ele acreditava em seu potencial e sabia que venceria, mas sentia aquele friozinho na barriga quando se lembrava do desafio que tinha de enfrentar. Havia acabado de adquirir um imóvel que possuía a estigma de fracasso dos dois empreendimentos antecessores, não estava localizado na feira, mas numa área livre, com movimentação menor e de pouca tradição para o comércio. Acontece que o supermercado Cerqueira já nasceu forte, com uma boa clientela, com credibilidade entre os fornecedores e a comunidade, além de contar com um administrador tenaz e corajoso, que não chegou a concluir o primário em seus estudos, mas possuía um conhecimento prático muito valioso, além de possuir muita simpatia e carisma. Este diferencial foi fundamental para garantir o seu sucesso.​
Os anos passam e aquela preocupação inicial de como preencher tanto espaço vazio mudou, passou a ser a necessidade de se ter mais espaço para expor melhor os produtos, devido à grande variedade de itens que passou a trabalhar. Variedade sempre foi um ponto forte nesta empresa, aliada ao atendimento personalizado e preços competitivos, o empreendimento foi crescendo até ser considerado como o melhor supermercado da cidade, atestado em todas as pesquisas de opinião realizadas em São Filipe até os dias atuais.​
Em 1992, apesar de a hiperinflação corroer a economia, a empresa estava crescendo, mas aconteceu o inesperado, o empresário empreendedor e fundador desta empresa Sebastião Lessa de Cerqueira não resiste a um ataque cardíaco e falece no dia 21 de janeiro, um dia após ter completado 55 anos de idade, em sua residência, onde se recuperava de uma torção em seu pé esquerdo que já completava um mês. Todos foram pegos de surpresa, ninguém esperava um acontecimento desta natureza. Pela primeira vez as portas se fecham por três dias consecutivos.​
Dona Tereza e seus filhos Evandro, Edvaldo, Eduardo, Egnaldo e Lúcia, além de Edson, seu sobrinho, e os demais colaboradores, assumiram a responsabilidade de dar continuidade aos negócios, desta vez sem o principal líder, aquele que dava a última palavra, que corrigia os erros, orientava, assumia as responsabilidades. Todos já conheciam os caminhos a seguir, apenas nunca andaram sozinho sem o guia principal.​
Diante da estrutura deixada por Sebastião, em pouco tempo os seus herdeiros conseguiram ampliar seus negócios com a aquisição do imóvel onde funcionou o primeiro supermercado da cidade, que nesta ocasião funcionava o Supermercado Oliveira Brito, administrado pelo casal Célio e Lídia Brito, filha dos proprietários do imóvel Dr. Vinício e Dona Vera. A transação foi efetuada no final deste mesmo ano 1992, só que a inauguração da loja número 2 do supermercado Cerqueira foi no dia 03 de junho de 1993. Foi um momento de muita emoção para a família, afinal provava que Sebastião havia sido um vencedor, não só criou uma empresa sólida como deixou em condições de evoluir.​
Com duas lojas, os supermercados Cerqueira passaram a inovar para facilitar a vida dos clientes, dentre os serviços disponíveis os mais elogiados pelos clientes na época foram a entrega em domicílio e o crediário conjugado, no qual o cliente pode comprar ou pagar em qualquer uma das lojas pois a conta é unificada .​
Em 1994 a economia brasileira entra uma nova fase, a da estabilidade, o dragão da inflação passa a ter um controle, nunca vistos pelos novos administradores. Tudo passou a ser diferente, não havia mais a necessidade de grandes estoques, os prazos tanto nas compras como nas vendas a crédito puderam ser maiores, muitos produtos estavam acima do valor real, devido a correção da URV, e gradativamente foram recuando , gerando alguns prejuízos que foram absorvidos pela empresa. Passada a fase de transição, a estabilidade teve resultados positivos, o consumidor, a cada ano, aumentava seu poder de compra, pois o dinheiro tinha valor do início ao fim do mês. As pessoas conseguiam planejar melhor e comprar mais conscientemente.​
O tempo passa e a loja 1 estava cada vez mais apertada, pois funcionava o atacado e varejo, com isso surge a necessidade de separar essas duas atividades e no local onde iniciou tudo, no antigo Bar e Sorveteria Q’Ótimo é aberto uma nova empresa do grupo: o Cerqueira Atacado, com o objetivo de atender melhor seus clientes e oferecer melhores preços. Atualmente continua em pleno funcionamento, com foco voltado para os pequenos comerciantes e para realizações de eventos festivos, fornecendo material de apoio como mesas e frízeres e agora se solidifica como revenda de pneus.​
Mesmo com essa nova loja, a matriz dos Supermercados Cerqueira continuava sem espaço adequado, por isso em 1999 deu-se início à sua primeira grande reforma de ampliação. Para aumentar a frente foi feita uma negociação com os comerciantes vizinhos, proprietários da Mila Modas, Conce e Zeca de Virgílio, como são conhecidos popularmente. Nessa negociação foi feita uma permuta de imóveis, sendo construída uma loja nova onde funcionava parte do depósito de mercadorias e em troca o supermercado ficaria com o imóvel da loja. Negócio combinado verbalmente, sem nenhum papel assinado, como nos tempos antigos, onde prevaleceu a amizade, honestidade e palavra dos negociadores.​
A obra não parou por aí, foi feita demolição total da loja e da área remanescente do depósito e construído um prédio novo com laje. Com isso a área de vendas aumentou consideravelmente e o depósito ficou em sua maior parte no pavimento superior. Para esse grande empreendimento os sócios contaram com o apoio dos Bancos do Brasil e do Nordeste.​
Em 2001 a loja está de cara nova e a comunidade comemora esta conquista. A loja 2 também fez algumas inovações em sua estrutura interna , ampliando um pouca a área de vendas e fazendo melhoramentos no acabamento do prédio, como troca de forro, instalações comerciais, piso entre outros investimento importantes.​
Em 2002 é anexado ao prédio da loja 1 a primeira agência lotérica da cidade a Lotérica Bote Fé, possibilitando assim às pessoas a fazerem suas apostas, pagamentos de contas e outras transações bancárias autorizadas pela Caixa Econômica Federal.​
Em 2006 as duas lojas iniciaram outra grande reforma. A loja 1 comprou o imóvel que havia construído para a Mila modas e posteriormente uma pequena casa comercial onde funcionava uma barbearia, de propriedade de Sr Juvenal, conhecido por Seu Nazinho. Com estas aquisições sua fachada ampliou consideravelmente e a loja ganhou mais área de vendas e o depósito passou a ser totalmente no pavimento superior, pois toda área térrea passou a ser destinada a vendas. Foi uma mudança inclusive na logomarca e no leiaute interno, sendo contratados profissionais especializados para elaborar os projetos.​
A loja dois seguiu o mesmo destino, demoliu toda área do depósito, onde construiu um prédio novo com dois pavimentos, para depósito e o espaço térreo também ficou disponibilizado para as vendas e atualmente oferece também o serviço de lanchonete e restaurante com deliciosos pratos a preços baixos. Ambas as lojas adquiriram equipamentos novos e instalações comerciais modernas e aumentaram o número de caixas e implementação de novas tecnologias, como a colocação de balanças nos caixas, sendo pioneiros em São Filipe. As balanças são as mais modernas do mercado e ficam embutidas nos checkouts, seguindo os padrões de ergonomia das leis trabalhistas.​
Em 2011, pensando em fortalecer ainda mais as ações da empresa, as duas lojas dos Supermercados Cerqueira filiaram-se à maior rede de supermercados do Brasil, a Rede Smart de Supermercados, agregando assim novos serviços dentre eles se destacam o sistema TEF nos caixas para o uso de cartões de crédito e débito, os jornais de ofertas mensais além de promoções semanais como quinta filé e sexta maluca, o cartão de crédito SMART, o quiosque eletrônico com vendas via internet, diversos produtos de marca própria, fabricado pelas melhores indústrias brasileiras com preços inferiores aos das marcas líderes, recebimento de contas e boletos bancários, além de uma consultoria constante sobre as novidades do mercado.​
No decorrer desses 25 anos de existência, os Cerqueira Smart Supermercados lojas 1 e 2 sempre se preocuparam em treinar e capacitar seus colaboradores, através de cursos e palestras, ministradas por profissionais capacitados, com apoio do Sebrae, Associação Comercial , da Abase e agora também da Smart com cursos EAD . A seleção criteriosa dos colaboradores no que diz respeito ao profissionalismo, respeito e confiança, visa principalmente a prática de um atendimento que, não só esteja de acordo com as expectativas do cliente, mas também que o  surpreenda, o encante. Elogios são sempre proferidos sobre esta qualidade, sinal de reconhecimento pelos esforços de toda equipe que se dedica a atender esta comunidade e seus visitantes com alegria e presteza. O slogan : Certeza de economia, abrange diversos aspectos, não apenas o preço, que logicamente está inserido em seu significado, mas também a economia de tempo para efetuar suas compras, devido à facilidade e comodidade de encontrar tudo em um só lugar, melhor espaço e exposição dos produtos, maior quantidade de checkouts , utilização das tecnologia já mencionadas acima, mais carrinhos e cestas para compras, duas lojas em locais estratégicos, maior variedade de produtos, melhor sistema de crediário próprio, ser a empresa do ramo que aceita a maior quantidade de cartão eletrônicos de crédito, débito e alimentação e ainda a entrega das compras em domicilio. Com estes serviços e produtos de qualidade e o melhor atendimento  os Cerqueira Smart Supermercados consolidam-se na preferência dos filipenses, mas sabem que ainda tem muito a melhorar, reconhecem o empenho de todos os colaboradores para alcançar estas conquistas e agradecem primeiramente a Deus, o criador de tudo e a todos os clientes que são a sua razão de sua existência.